李新在10月16日那天就乘上了专用的游轮，踏上了返回国内的道路。出去港口不到半天就接到一封电报。电报上告知李新，中国已经与日本谈妥，再次派遣大使到日本明治政府那里。外交部询问一下李新对新人选的态度。
李新对这个消息很是意外，明治政府这么快就向中国屈服了么？他原本以日本的态度，总得坚持一年多，甚至是等待英国重返日本。
明治政府的确这么快就暂时屈服了。木户孝允坐在大久保利通对面，10月的东京正是深秋，庭院里面的枫叶通红似火，飘落的枫叶在地面上覆盖了厚厚的一层火红。几片枫叶飘落在庭院里面的小水潭中，树冠遮住了日光，幽暗的水面点缀着醒目的红色叶片半沉半浮，有着一种令人陶醉的美丽。
木户孝允却没有欣赏这些，他有点焦虑的说道：“在现在这种时候与中国恢复外交关系，会被认为是叛国的！”
“他们想这么骂我们，那是他们的事情。现在的关键是我们自己能否下定决心。”大久保利通语气颇为淡定的答道。不过想到现在日本国内的反对者，大久保利通忍不住冷笑起来，“呵呵，木户，那些士族咒骂我们导致了北海道讨伐战失败。可我现在倒是觉得讨伐战很成功么。若是他们真的如他们所说的那般忠于天皇，士族们为何要抱怨死了几万人？他们应该夸称自己在北海道杀了几十万逆贼的功劳才是。”
木户孝允和这时代的武士一样，也亲手杀过人。他当志士时代被幕府追杀，曾不顾性命持续在京都地下活动。长州藩在戊辰战争中作风凶狠杀戮很重，木户孝允也参与过制定战争计划，亲自下了不少命令。听了大久保利通这冷酷的发言，木户孝允也忍受不了了，他很不高兴的说道：“大久保，你这么说实在是太过分了！”
大久保利通并没有因为木户孝允的不高兴而生气，他从容的给自己倒了杯茶后才继续说道：“木户，这些人迟早都会造反的。他们反抗国家的时候只会被当作逆贼处死，现在让他们的死是在为国捐躯，我是在成全他们的名声。”
这次木户孝允并没有立刻反驳，大久保利通说的内容非常残酷，却是一针见血。明治政府成立之后，下达“藩治职令”（统一各藩官制，强化政府对藩的监督控制；不受门第和旧习限制，提拔人才；藩政与藩主的家政分离），接着又在木户孝允和大久保利通一起推行“奉还版籍”；同时要求萨摩、长州、土佐、肥前四藩向朝廷贡献兵力，设立御亲兵；后又实施“废藩置县”。
这些政策的目的是要改造旧日本，推动工业化发展。在用新制度替代旧制度，就一定会遭到旧制度既得利益者的反对。废藩置县后，旧有的社会主流体系被彻底摧毁。新制度下面的所有官员都是通过国家控制的教育和考试体系层层选拔出来的。在这个方面，大久保利通等人完全照搬了中国的公务员制度。这个制度的威力很容易就显露出来，相同的选拔标准，相同的公务员考试题目。大量支持中央集权的人员成为了公务员预备军。
士族利益代表者西乡隆盛等人搞出了“征韩论”，经过御前会议讨论之后遭到了天皇正式否定。西乡等征韩五参议愤然辞职，大批持士族立场的官员和近卫军军官也随之辞职。支持中央集权的公务员们轻松接掌了明治政府的各级官职。
到了此时，双方的矛盾已经接近不可调和的阶段。讨伐虾夷共和国的军事行动算是最后妥协的可能。在6月，发现战局不利的大久保利通就要求士族军队暂时撤出北海道。士族军队拒绝了大久保利通的建议，继续在北海道坚持作战。等战局到了无法挽回的时候，士族们就要求政府军出动，来扭转乾坤。
木户孝允承受了极大的压力，可他也没办法。虾夷共和国的海军中聚集了日本相当优秀的一批海军指挥官，他们不求歼灭明治政府的海军，而是极力拖住明治政府的海军。政府军已经无力援助。
士族军队被歼灭，双方的矛盾再也没有了缓和的可能。民间的士族们强烈要求明治政府集体辞职，由士族们选出的政府成员组成新政府。明治政府根本不可能答应这种要求，木户孝允也看透了这帮人背后隐藏的心思。
“大久保，你相信能够说服中国不支持他们么？”木户孝允把话题转回到最初的问题上。中国正在支持虾夷共和国，内战一起，保不准中国就会继续支持士族。